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上海生科院Philipp Khaitovich研究组**绘制哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱

    近日,国际学术期刊《Genome Biology and evolution》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所Philipp Khaitovich研究组的研究论文“Changes in snoRNA and snRNA abundance in the human, chimpanzee, macaque and mouse brain”。该研究**绘制了哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱,发现哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达水平存在广泛差异。
    snRNA和snoRNA是功能和进化保守的转录调控元件,但长期以来缺乏其在人脑转录组水平的系统研究。Philipp Khaitovich研究组与俄罗斯莫斯科大学Mikhail S. Gelfand教授合作,利用高通量测序技术系统地测定了人、黑猩猩、恒河猴和小鼠大脑前额叶皮质组织中snRNA和snoRNA的表达量,通过比较分析发现snRNA和snoRNA在基因家族水平上非常保守,但是其中U1和SNORA29表达量在人脑中却发生了巨大变化。SNORA29 在人脑中表现为特异表达缺失,并且实验发现SNORA29在非人灵长类的神经元中特异表达,提示其在人脑认知功能形成中的潜在作用。同时,该研究发现与mRNA的表达主要受启动子调控不同,二级结构稳定性是snoRNA表达调控的重要机制。
    本研究是对snRNA和snoRNA在人脑进化中作用的多物种系统性研究,对于探寻人脑认知功能的分子调控机制具有重要意义。

    Genome Biol Evol:上海生科院Philipp Khaitovich研究组**绘制哺乳动物大脑snRNA和snoRNA表达图谱
    snoRNA表达量调控机制示意图: mRNA表达量主要由启动子和增强子的转录活性高(浅蓝)低(深蓝)决定。snoRNA表达量不依赖宿主基因,而主要由自身结构稳定性高(红)低(蓝)决定。

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